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Centro Universitario de la Costa Sur

Centro Universitario de la Costa Sur

Alma Paola Rodríguez Troncoso

Categoría: Profesor- Investigador Teléfono: 3222262319  
Email: alma.rtroncoso@academicos. udg.mx Extensión: 66319
Skype: Departamento: Ciencias Biológicas
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Alma_Rodriguez-Troncoso2 Centro Universitario: Centro Universitario de la Costa

 

Licenciada en Biología Marina por la Universidad del Mar, con tesis sobre reproducción en corales hermatípicos en la región sur del Pacífico Mexicano, trabajo que fue continuado  y profundizado durante la Maestría en Oceanografía Costera en la Universidad Autónoma de Baja California-Instituto de Investigaciones Oceanológicas (UABC-IIO). Doctora en Ciencias en Oceanografía Costera (2010) igualmente por la UABC-IIO, estudiando la respuesta fisiológica y celular causada por el efecto del estrés térmico en las comunidades coralinas del Pacífico Central Mexicano. Tiene la distinción de Candidato en el SNI desde enero del 2012, y se desempeña como becaria posdoctoral en el Centro de Investigaciones Costeras (CUC-UdeG), continuando con la línea de investigación desarrollada durante su trabajo doctoral, sumando otros marcadores fisiológicos, así como diferentes escenarios térmicos, para generar tanto aproximaciones experimentales como  in situ, con el fin de evaluar la respuesta de la comunidad coralina de la región ante futuros escenarios anómalos asociados con eventos ENSO y el cambio climático. De manera adicional, está realizando estimaciones importantes tales como la tasa de crecimiento y capacidad reproductiva. Asimismo, participa dentro del monitoreo marino en el Parque Nacional Islas Marietas e Isla Isabel desde su incorporación al instituto.

1. Ecofisiológica de invertebrados marinos.
2. Ecología de comunidades coralias.
3. Respuesta de las comunidades coralinas ante el efecto del Cambio Climático

              1. Proyectos de investigación a mi cargo.

2023-2025 From restoration to rehabilitation of coral communities: urgent actions to achieve their conservation (NGS-100354C-23).

2021-a la fecha. Red de Monitores Ciudadanos para evaluar la salud de las comunidades coralinas del Pacífico Mexicano. Adventures Scientist: https://www.adventurescientists.org/mexico-reefs.html.

2019-2021 Coral restoration of the coral communities: Promoting local actions for global Impacts (NGS-55349R-19).

2018-2020 Coral reef conservation in the Central Mexican Pacific: vulnerability of corals to anthropogenic threats (National Geographic Society – EC-51496C-18).

2017-2018 Estudio de Límite de Cambio Aceptable, para regular las actividades turístico recreativas que se desarrollan en el Mahahual-Xahuayxol, en la Reserva de la Biosfera Caribe Mexicano (CONANP/ PROMANP2017 No. F00.9.DRPYCM.UTCMR.-475/2017).

2. Proyectos de investigación en colaboración

2021-2024. Evaluación de la función geo-ecológica de los arrecifes coralinos del Pacífico mexicano (CONACYT CF 2019/86397).

2016-2018. Restauración de Arrecifes Coralinos en el PN Islas Marietas (Proyecto PROCER/CCER/DROPC/09/2016)

2014-2017. Estimación de la capacidad de carga por buceo en el Parque Nacional Islas Marietas (Proyecto PROCODES)

 

Ochoa-Serena A. Tasas de acreción neta de carbonatos en el arrecife coralino remoto Atolón Clipperton del Pacífico Tropical Oriental. Agosto 2023-Actual.

de Alba-Guzmán C.  Variación inter-décadal en la estructura de la comunidad coralina del Parque Nacional Islas Marietas, México. Agosto 2021-Actual

Humara-Gil, K.J.. Revisión del complejo de especies “Ophioderma teres (Echinodermata: Ophiuroidea) del Pacífico oriental. Agosto 2019-Actual

Nivel Doctorado.

Canizales-Flores M.H. (2023) Respuesta de la relación simbiótica entre el coral del género Pocillopora spp. y el cangrejo del género Trapezia spp. ante distintos escenarios de estrés, referentes al cambio climático.  

Martínez-Castillo V. (2021) Respuesta de las comunidades de corales de bahía de banderas al incremento del desarrollo turístico-urbano. Universidad de Guadalajara. 110 pp.

Santiago-Valentín, J.D. (2019) Determinación del éxito reproductivo en los principales géneros de corales pétreos asociadas a las comunidades coralinas del Pacífico Central Mexicano. Universidad de Guadalajara Centro Universitario de la Costa, 107 pp.

Sotelo-Casas, R.C. (2017) Variación espacio-temporal del ensamblaje de equinodermos asociados a las comunidades coralinas del Pacífico Central Mexicano. Universidad de Guadalajara, Centro Universitario de la Costa, 128 pp.

 Tortolero-Langarica, J.J.A. (2016) Evaluación de las tasas de calcificación de los principales géneros de coral hermatípico asociados al Pacífico Central Mexicano. Universidad de Guadalajara, Centro Universitario de la Costa, 129 pp.

Nivel Maestría.

Cruz-García, R (2018) Evaluación de la respuesta al blanqueamiento en los corales hermatípicos asociados a la comunidad coralina del Parque Nacional Islas Marietas, Nayarit, México. Universidad Nacional Autónoma de México- ICMyL, 48 pp.

Burroughs, E (2023) A social-ecological análisis of coral reef ecosystem health and stakeholder perceptions at Islas Marietas National Park. University Centre of the Westfjords, Islandia, 124 pp.

Nivel Licenciatura

Gómez-Camarena, B.G. (2022) Variación inter-anual de la clase echinoidea asociada a la comunidad coralina del Parque Nacional Islas Marietas. Universidad de Guadalajara, Centro Universitario de la Costa, 46 pp.

Contreras-Medellín López, P. (2021) Tasa de crecimiento del coral del género Pocillopora en el Pacífico Central Mexicano y su relación con condiciones ambientales locales. Universidad de Guadalajara, Centro Universitario de la Costa Sur, 39 pp.

Velarde-Lemus, J.A. (2018). Catálogo de identificación taxonómica de holothuroideos del Parque Nacional Islas Marietas, México. Universidad de Guadalajara, Centro Universitario de la Costa, 41 pp.

Padilla-Pérez, M. (2018). Equinodermos del Parque Nacional Islas Marietas: Generalidades, importancia e identificación visual como herramienta para su protección. Universidad de Guadalajara, Centro Universitario de la Costa, 91 pp.

Padilla-Guzmán, R. (2017). Restauración de la cobertura coralina de Parque Nacional Islas Marietas y Punta de Mita, Nayarit, México. Universidad de Guadalajara, Centro Universitario de la  Costa. 40 pp.

Martínez, F.A. (2014). Variabilidad anual en el reclutamiento de invertebrados marinos, asociados a la comunidad coralina del Parque Nacional Islas Marietas, Nayarit, México. Benemérita Universidad Autónoma de Puebla, 41 pp.

Cruz-García, R. (2013) Abundancia de tres especies de Isópodos (Peracárida: Isopoda) asociado a un ambiente coralino en el Pacífico Mexicano. Universidad de Guadalajara, Centro Universitario de la Costa, 11 pp

ARTÍCULOS PUBLICADOS

Morales-de-Anda D., Cupul-Magaña A.L., Rodríguez-Zaragoza F.A., Aguilar-Betancourt C., González-Sansón G., Rodríguez-Zaragoza F.A., Rodríguez-Troncoso A.P. (2024). Herbivorous Reef Fish Interaction with the habitat and physicochemical variables in coral ecosystems in the Mexican Tropical Pacific. Oceans, 5, 21–37. https://doi.org/10.3390/oceans5010002.

Martínez-Castillo, V., Rodríguez-Troncoso, A.P., Cupul-Magaña A.L. (2023). Evidence of Sexual Reproduction in Out-Planted Coral Colonies, 4, 350– 360. https://doi.org/10.3390/ oceans4040024.

Muñoz-Alfaro, A., Rodríguez-Troncoso A.P., Cupul-Magaña A.L., Tortolero- Langarica J.J.A., Cabral-Tena, R. (2023). Evaluación de la restauración active mediante el índice de función arrecifal en arrecifes del Parque Nacional Islas Marietas. Hidrobiológica, 33 (2): 127-137

Montalvo-Jaramillo, L. M., Rodríguez-Troncoso A.P., Cupul-Magaña A.L., Cabral-Tena, R. (2023). Funcionalidad física como indicador de disponibilidad de hábitat en Islas Marietas, Nayarit, México. Hidrobiológica, 33 (2): 149-156.

De Alba-Guzmán, C., Rodríguez-Troncoso A.P., Cabral-Tena R.A., Rodríguez-Zaragoza, F.A., Tortolero-Langarica, J.J.A., Cupul-Magaña A.L. (2023). Taxonomical and functional diversity dynamics of conspicuous echinoderms in the northeastern tropical Pacific over a decade. Marine Environmental Research. 188, 106037. Doi: https://doi.org/10.1016/j.marenvres.2023.106037

Tortolero-Langarica, J.J.A., Rodríguez-Troncoso A.P., Alvarez-Filip L., Cupul-Magaña A.L., Carricart-Ganivet, J.P. (2023) The contribution of assisted coral restoration to calcium carbonate production in Eastern Pacific reefs. Revista de Biología Tropical, 71(S1), e54849. https://doi.org/10.15517/rev.biol.trop..v71iS1.54849

Rodríguez-Troncoso A.P., Tortolero-Langarica, J.J.A., Padilla-Guzmán R., Kelly-Gutiérrez L.D., Cupul-Magaña A.L. (2023). Spatio-temporal variation in the growth of coral fragments of opportunity in the Eastern Tropical Pacific: implications for coral reef restoration. Revista de Biología Tropical, 71(S1), e54850. https://doi.org/10.15517/rev.biol.trop..v71iS1.54850

Gómez-Petersen P., Tortolero-Langarica J.J.A., Rodríguez-Troncoso A.P., Cupul-Magaña A.L. Oritz M., Ríos-Jara E., Rodríguez-Zaragoza, F.A. (2023). Testing the effectiveness of natural and artificial substrates for coral reef restoration at Isla Isabel National Park, Mexico. Revista de Biología Tropical, 71(S1), e54738. https://doi.org/10.15517/rev.biol.trop..v71iS1.54738

Rodríguez-Troncoso A.P., Tortolero-Langarica, J.J.A., Contreras-Medellín P., Canizales-Flores H., Godínez-Dominguez E., Cupul-Magaña A.L. (2023). Evaluación de los indicadores demográficos de Pocillopora (Scleractinia: Pocilloporidae) en sitios insulares vs. costeros: Implicación para un programa de restauración regional. Revista de Biología Tropical, 71(S1), e54790. https://doi.org/10.15517/rev.biol.trop..v71iS1.54790

Martínez-Castillo, V., Rodríguez-Troncoso, A.P., Tortolero-Langarica, J.J.A., Cupul-Magaña A.L. (2023). Active restoration efforts in the Central Mexican Pacific as a strategy for coral reef recovery. Revista de Biología Tropical, 71(S1), ee54795. https://doi.org/10.15517/rev.biol.trop..v71iS1.54795

Bautista-Guerrero, E., Carballo J.L., Rodríguez-Troncoso, A.P. (2023). Crambe insularis sp. nov. (Crambeidae: Poecilosclerida) a New Crambeid from the Eastern Tropical North Pacific: Morphological, Molecular and Ontogenetic Approach. Diversity. 15, 608.  https://doi.org/10.3390/d15050608

Pérez de-Silva C.V., Cupul-Magaña A.L., Rodríguez-Zaragoza, F.A., Rodríguez-Troncoso, A.P. (2023). Temporal oceanographic variation using satellite imagery data in the central Mexican Pacific convergence zone. Ciencias Marinas. 49: e3260. https://doi.org/10.7773/cm.y2023.3260

Pedraza-Pohlenz, R.M., Balart E.F., Tortolero-Langarica J.J.A., Rodríguez-Troncoso, A.P., Hellberg M.E., Norzagaray-López O., Cabral-Tena R.A., Cupul-Magaña A.L., Paz-García D.A. (2023). Sexual dimorphism in corallite size and modularity of a broadcast spawning coral, Porites lobata. Frontiers in Marine Science. 9: 1068391. https://doi.org/10.3389/fmars.2022.1068391.

Santiago-Valentín, J., Zavala-Casas D.A., Herández-Penagos L.E., Rodríguez-Troncoso, A., Torres-Hernández P., Benitez-Villalobos F.,  López-Pérez, A. (2023) Reproductive and physiological plasticity of scleractinian corals in response to changes in environmental conditions. Hydrobiologia. 850, 577-590. https://doi.org/10.1007/s10750-022-05101-6

Ostria-Hernández M.L., Hernández-Zulueta J., Vargas-Ponce O., Díaz-Pérez L., Rodríguez-Troncoso, A.P., Ríos-Jara E., Rodríguez-Zaragoza, F.A. (2022) Core microbiome of corals Pocillopora damicornis and Pocillopora verrucosa in the north-eastern tropical Pacific. Marine Ecology. 43: e12729. https://doi.org/10.1111/maec.12729

Tortolero-Langarica, J.J.A., Cluna E., Rodríguez-Zaragoza, F.A., Caselle, J. E.,  Rodríguez-Troncoso, A.P., Adjeround M., Friedlander, A.M., Cupul-Magaña, A.L., Ballesteros E., Carricart-Ganivet, J. P., Brown E.K. (2022) Spatial and temporal patterns in the coral assemblaje at Clipperton Atoll: a sentinel reef in the Eastern Tropical Pacific. Coral Reefs. 41, 1405-1415. https://doi.org/10.1007/s00338-022-02290-3

Martínez-Castillo, V., Rodríguez-Troncoso, A.P., Bautista-Guerrero E., Cupul-Magaña A.L. (2022). Symbiont-coral relationship in the main reef building scleractinians of the Central Mexican Pacific. Symbiosis. 86, 315-323. https://doi.org/10.1007/s13199-022-00848-x

Humara-Gil J., Granja-Fernández R., Bautista-Guerrero E., Rodríguez-Troncoso, A.P. (2022). Overlooked for over a century: Ophioderma occultum sp. nov. (Echinodermata), a new species of brittle star from the Eastern Pacific. Journal of Natural History. 56: 365-384, https://doi.org/10.1080/00222933.2022.2071179

Ibarra‑García, E., Cáceres I., Ortiz M., Rodríguez-Troncoso, A.P., Ríos‑Jara E., Cupul-Magaña A.L., García Rivas M., Rodríguez-Zaragoza, F.A (2022) Effects of Hurricane Dean and tropical storm Karl on the coral reef fish assemblage of Banco Chinchorro: temporal changes in rarity, and alpha and beta taxonomic diversity. Community Ecology. 23, 197-207. https://doi.org/10.1007/s42974-022-00093-8

Pérez de-Silva C.V., Cupul-Magaña A.L., Rodríguez-Troncoso, A.P., Rodríguez-Zaragoza, F.A. (2022) Reef fish assemblage in two insular zones within the Mexican central Pacific. Oceans. 3, 204–217. https:// doi.org/10.3390/oceans3020015

Martínez-Castillo, V., Rodríguez-Troncoso, A.P., Tortolero-Langarica J.J.A., Bautsta-Guerrero E., Padilla-Gamiño, J., Cupul-Magaña A.L. (2022). Coral performance and bioerosion in Central Mexican Pacific reef communities. Hydrobiologia. 894, 2395-2412. https://doi.org/10.1007/s10750-022-04879-9

Santiago-Valentín, J., Rodríguez-Troncoso, A., Bautista-Guerrero, E., López-Pérez, A., & Cupul-Magaña, A. (2022). Internal ultrastructure of the planktonic larva of the coral Porites panamensis (Anthozoa: Scleractinia). Revista De Biología Tropical, 70(1), 222-234. https://doi.org/10.15517/rev.biol.trop..v70i1.48648

Tortolero-Langarica, J.J.A., Rodríguez-Troncoso, A.P., Cupul-Magaña, A.L., Morales-de-Anda, D. E., Caselle, J. E., Carricart-Ganivet, J. P. (2022). Coral calcification and carbonate production in the Eastern Tropical Pacific: The role of branching and massive corals in the reef maintenance. Geobiology, 20, 533-545. Doi: org/10.1111/gbi.12491.

Martínez-Castillo, V., Rodríguez-Troncoso, A.P., Mayfield, A.B., Rodríguez-Zaragoza, F.A., Cupul-Magaña, A.L. (2022) Coral Recovery in the Central Mexican Pacific 20 Years after the 1997–1998 El Niño Event. Oceans, 3, 48–59. https://doi.org/10.3390/oceans3010005

Canizales-Flores M.H., Rodríguez-Troncoso A.P., Rodríguez-Zaragoza F.A., Cupul-Magaña A.L. (2021). A Long-Term Symbiotic Relationship: Recruitment and fidelity of the crab Trapezia on its coral host Pocillopora. Diversity, 13, 450. doi: 10.3390/d13090450                          ISSN: 1424-2818.

González-Pabón M.A., Tortolero-Langarica J.J., Claderon-Aguilera L.E., Solana-Arellano E., Rodríguez-Troncoso A.P., Cupul-Magaña A.L., Cabral-Tena R.A. (2021) Low calcification rate, structural complexity, and calcium carbonate production of Pocillopora corals in a biosphere reserve of the central Mexican Pacific.  Marine Ecology. doi: 10.1111/maec.12678. ISSN: 1439-0485

Cosain-Díaz J.A., Tortolero-Langarica J.J.A., Rodríguez-Troncoso A.P., Bautista-Guerrero E., Antuna-Roman D.M., Salazar-Silva P., Cupul-Magaña A.L. (2021). Internal bioerosion in massive corals associated to reef communities of the Central Mexican Pacific: The effect of intrinsic and extrinsic factors. Ciencias Marinas. 41: 33-47, doi: 10.7773/cm.v47i1.3047. ISSN: 2395-9053.

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Canizales-Flores M.H., Rodríguez-Troncoso A.P., Bautista-Guerrero E., Cupul-Magaña A.L. (2020). Molecular Phylogenetics of Trapezia Crabs in the Central Mexican Pacific. Oceans. 1: 156-164. doi:10.3390/oceans1030011. 1: 156-164, ISSN: 0029-8018.

Martínez-Castillo V., Rodríguez-Troncoso A.P., Santiago-Valentín J.D., Cupul-Magaña A.L. (2020). The influence of urban pressures on coral physiology on marginal coral reefs of the Mexican Pacific. Coral Reefs. 39: 625-937. doi: 10.1007/s00338-020-01957-z. ISSN: 0722-4028.

Martínez-Castillo V., Rodríguez-Troncoso A.P., Reyes-Bonilla H., Aguilar-Cruz C.A., Rangel-Dávalos C. (2020). Reproduction of the endangered endemic saffron coral to the Gulf of California Porites sverdrupi (Anthozoa: Scleractinia): implications for its long‑term maintenance. Helgoland Marine Research. 74: 6. doi: doi.org/10.1186/s10152-020-00538-5. ISSN: 1438-3888.

Smallhorn-West P., Sheehan J., Rodríguez-Troncoso A., Malimali S., Halafihi T., Mailau S., Le’ota A., Ceccarelli D., Stone K., Pressey B., Jones G. (2020) Kingdom of Tonga Special Management Area report 2020. 86 p.

Morales-de-Anda D., Cupul-Magaña A.L., Rodríguez-Zaragoza F.A., Aguilar-Betancourt C., González-Sansón G., Rodríguez-Troncoso A.P. (2020). Reef fish functional composition and metrics reveal spatial differences in three protected islands in the Eastern Pacific. Marine Ecology Progress Series. 635: 139-150. doi: 10.3354/meps13186. ISSN:  0171-8630.

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Cruz-García R., Rodríguez-Troncoso A.P., Rodríguez-Zaragoza F.A., Mayfield, A. Cupul-Magaña A. (2020) Ephemeral effects of El Niño southern oscillation events on an eastern tropical Pacific coral community. Marine and Freshwater research. doi: 10.1071/MF18481. ISSN: 1323-1650.

Bautista-Guerrero E., Llera-Herrera R., Carballo J.L., Rocha-Olivares A., Rodríguez-Troncoso A.P., González-Castillo A., Cruz-Barraza, J.A. (2020). The complete mitogenome of excavating sponge Thoosa mismalolli (Demospongiae, Tetractinellida, Thoosidae) from Northeastern Tropical Pacific. Mitochondrial DNA Part B, 5, 689-691, doi: 10.1080/23802359.2020.1714499. ISSN: 2380-2359.

Sotelo-Casas R., Rodríguez-Troncoso A.P., Rodríguez-Zaragoza F.A., Solis-Marín F.A., Godínez E., Cupul-Magaña A. (2019) Spatial-temporal variations in echinoderm diversity within coral communities in a transitional region of the northeast of the Eastern Pacific. Estuarine Coastal and Shelf Science. 227: 106346, doi: 10.1016/j.ecss.2019.106346. ISSN: 0272-7714.

Tortolero-Langarica J.J.A., Rodríguez-Troncoso A.P., Cupul-Magaña A.L., Alarcón-Ortega L.C., Santiago-Valentín J.D. (2019) Accelerated recovery of calcium carbonate production in coral reefs using low-tech ecological restoration. Ecological engineering. 128: 89-97. doi: 10.1016/j.ecoleng.2019.01.002. ISSN: 0925-8574.

Rodríguez-Troncoso A.P., Rodríguez-Zaragoza F.A., Mayfield A.B., Cupul-Magaña A.L. (2019) Temporal variation in invertebrate recruitment on an Eastern Pacific coral reef. Journal of Sea Research. 145: 8-15. doi: 10.1016/j.seares.2018.12.007. ISSN: 1385-1101; FI: 1.729.

Santiago-Valentín J.D., Rodríguez-Troncoso A.P., Bautista-Guerrero E., López-Pérez R.A., Cupul-Magaña A.L. (2019) Successful sexual reproduction of the scleractinian coral Porites panamensis: evidence of planktonic larvae, and recruitment.  Invertebrate Biology. 138: 29-39. doi: 10.1111/ivb.12235. ISSN: 1744-7410.

Peña-Joya K.E., Téllez-López J., Rodríguez-Zaragoza F.A., Rodríguez-Troncoso A.P., Quijas S., Cupul-Magaña F.G. (2018) Diversidad taxonómica de lagartijas (Squamata: Lacertilia), asociada a cuatro tipos de vegetación de la sierra El Cuale, Jalisco, México. Acta Zoológica Mexicana. 34: 1-12. doi:  10.21829/azm.2018.3412129. ISSN: 2448-8455.

Cabral-Tena R.A., López-Pérez R.A., Reyes-Bonilla H., Calderón-Aguilera L.E., Norzagaray-López C.O., Rodríguez-Zaragoza F.A., Cupul-Magaña A.L., Rodríguez-Troncoso A.P., Ayala-Bocos A. (2018). Calcification of coral assemblages in the eastern Pacific: Reshuffling calcification scenarios under climate change. Ecological Indicators. 95: 726-734. doi: 10.1016/j.ecolind.2018.08.021. ISSN: 1470-160X.

Santiago-Valentín J.D., Colley S.B., Glynn P.W., Cupul-Magaña A.L., López-Pérez R.A., Rodríguez-Zaragoza F.A., Benítez-Villalobos F., Bautista-Guerrero E., Zavala-Casas D.A., Rodríguez-Troncoso A.P. (2018) Regional and species specific sexual reproductive patterns of three zooxanthellate scleractinian corals across the Eastern Tropical Pacific. Marine Ecology. e12497. doi: 10.1111/maec.12497 ISSN: 1439-0485.

Sotelo-Casas R.C., Cupul-Magaña A.L., Rodríguez-Zaragoza, F.A., Solís-Marín, F.A. y Rodríguez-Troncoso A.P. (2018). Structural and environmental effects on an assemblage of echinoderms associated with a coral community. Marine Biodiversity. 8: 1401-1411. doi: 10.1007/s12526-016-0622-y. ISSN: 1867-1624.

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Alarcón-Ortega L.C., Cupul-Magaña A.L., Rodríguez-Troncoso A.P, Cupul-Magaña F.G. (2017). Diversity and distribution of caprellids (Crustacea: Amphipoda: Caprellidae) in the Eastern Tropical Pacific region: Review of the literature. Hidrobiologica. 27: 229-239. ISSN: 0188-8897.

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CAPÍTULOS DE LIBROS

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Hernández-Ayón M. Chapa-Balacorta C., Olivia-Mendez N., Sosa-Ávalos R., Espinosa-Carreón T.L., Caso M., Ávila-Lopez M.C., Norzagaray-López N., Beas R., Lara-Lara R., Cupul-Magaña A., Rodríguez-Troncoso A.P., Franco Nobela A., Cervantes-Díaz G., López-Pérez A. (2019) Capítulo 4. Acidificación de los Mares Mexicanos. En: Estado del Ciclo de Carbono-Agenda Azul y Verde: Ecosistemas Marinos. Pellat, F.P., Hernández-Ayón J.M., Sosa-Ávalos R., Velázquez-Rodríguez A.S. (Eds).  P. 65-85. ISBN: 978-607-96490-7

Norzagaray-López C.O., Calderón-Aguilera L.E., Álvarez-Filip L., Barranco-Servín L.M., Cabral-Tena R.A., Carricart-Ganivet J.P., Cupul-Magaña A.L., López-Pérez A., Pérez-España H., Reyes-Bonilla H., Rodríguez-Troncoso A.P., Tortolero-Langarica J.J.A. (2018) Base de datos de almacenes de carbonato de calcio en arrecifes coralinos de México. En: Elementos para políticas públicas: Ciclo del Carbono y sus interacciones. Volumen 2, Número 3. Velázquez-Rodríguez A, Paz-Pellat F, Rojo-Martínez M, Velázquez-Rodríguez O (eds.). Programa Mexicano del Carbono, p. 147-162 ISBN: 2448-5578.

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Quijas S., Rodríguez-Troncoso A.P., Cupul-Magaña A.L., Santiago-Valentín J.D., Rodríguez-Olivares K.P., Galaviz-Prada J.D., Olvera-Benítez J.A. (2016) Evaluación de la Biodiversidad y servicios ecosistémicos en la región costera de Bahía de Banderas, Jalisco-Nayarit, México. En: Tópicos sobre ciencias biológicas. Cupul-Magaña FG (ed.). Universidad de Guadalajara, p. 61-83. ISBN: 978-607-742-585-4.

Reimer J., Rodríguez-Troncoso A.P. (2014) Introducción a la química marina: importancia de los principales nutrientes inorgánicos en el océano. En: Temas sobre investigaciones costeras. Cifuentes Lemus JL y Cupul-Magaña FG (eds.). Universidad de Guadalajara, p. 9-27. ISBN: 978-607-742-054-5.

Rodríguez-Troncoso A.P., Tortolero-Langarica J.J.A. (2014) Corales: organismos base constructores de ecosistemas arrecifales. En: Temas sobre investigaciones costeras. Cifuentes Lemus JL y Cupul-Magaña FG (eds.). Universidad de Guadalajara, p. 33-55. ISBN: 978-607-742-054-5.

Sotelo-Casas R.C., Rodríguez-Troncoso A.P.. (2014) Los Equinodermos: invertebrados esenciales dentro de la estructura de la comunidad coralina. En: Temas sobre investigaciones costeras. Cifuentes Lemus JL y Cupul-Magaña FG (eds.). Universidad de Guadalajara, p. 56-81. ISBN: 978-607-742-054-5.

Rodríguez-Troncoso A.P., Sotelo-Casas R.C., Galván-Villa C.M., Godínez-Domínguez E., Flores-Ortega JR, del Castillo-Fernández KM, Corgos A, Solís-Marín FA. (2013) Equinodermos de la Costa Sur de Jalisco y Colima. En: Inventario de Biodiversidad de la Costa sur de Jalisco y Colima. Vol. 2. Godínez-Domínguez E. y Franco-Gordo MC (eds.). Universidad de Guadalajara, p. 46-60. ISBN: 978-607-742-054-5.

Cupul-Magaña A.L., Rodríguez-Troncoso A.P., Rodríguez-Zaragoza F.A., Calderón-Aguilera L.E. (2013) Arrecifes y comunidades coralinas de la costa Sur de Jalisco y Colima. En: Inventario de Biodiversidad de la Costa sur de Jalisco y Colima. Vol. 2. Godínez-Domínguez E. y Franco-Gordo MC (eds.). Universidad de Guadalajara, p. 6-13. ISBN: 978-607-742-054-5.