Coordinador del proyecto “Monitoreo ecológico de los arrecifes de Holbox (Área de Protección de Flora y Fauna de Yum-Balam), Q. Roo, para evaluar el impacto del Huracán Willma”. Proyecto patrocinado por USAID, ICRAN y el Fondo Mundial para la Naturaleza (WWF por sus siglas en ingles).
Coordinador del proyecto “Monitoreo ecológico participativo en la Reserva de la Biosfera Banco Chichorro, Q. Roo”. Proyecto patrocinado por Curtis and Munson Fundation, Kukulcan Plaza, Fondo Mundial para la Naturaleza (WWF por sus siglas en ingles) y la Comisión Nacional de Áreas Naturales Protegidas (CONANP).
Coordinador del proyecto “Segundo monitoreo ecológico de los arrecifes de Holbox (Yum Balam), Q Roo”. Proyecto patrocinado por Curtis and Munson Fundation, Kukulcan Plaza y el Fondo Mundial para la Naturaleza (WWF por sus siglas en ingles).
Coordinador del proyecto “Monitoreo ecológico participativo para evaluar los efectos del Huracán Dean en la Reserva de la Biosfera Banco Chinchorro, Q. Roo”. Proyecto patrocinado por Curtis and Munson Fundation, Royal Caribbean Ocean Fundation, Fondo Mundial para la Naturaleza (WWF por sus siglas en ingles) y la Comisión Nacional de Áreas Naturales Protegidas (CONANP).
Responsable del proyecto de investigación. 2009. Funcionamiento del ecosistema marino en el Parque Nacional Isla Isabel, Nayarit: conservación de biodiversidad y apoyo al manejo ecosistémico. PROMEP. 2008-2013. $500,000.00.
Co-responsable de un proyecto de investigación entre WWF-Centroamérica y U. de G. titulado “Evaluación de hábitats arrecifales críticos para la langosta espinosa (Panullirus argus) en los arrecifes de Cayos Miskitos Nicaragua y Media Luna Honduras: recolecta de información que apoya el manejo con enfoque de ecosistemas”.
Colaborador de un proyecto de monitoreo ecosistémico y de investigación entre la CONANP y la U. de G. en el arrecife coralino de la Reserva de la biosfera Banco Chinchorro, Q. Roo.
Colaborador en el proyecto en el proyecto “Inventario de Corales Pétreos, Asteroideos, Equinoideos y Peces Óseos de Arrecifes de la Costa de Jalisco, Colima y Michoacán” Proyecto CONABIO-CICESE. Año 2010.
Colaborador del Proyecto de Investigación “Apoyo a la investigación del Laboratorio de Ecosistemas Marinos y Acuicultura (LEMA) y responsable del objetivo 124661, Evaluar la Biodiversidad y el Funcionamiento del Ecosistema Marino del Parque Nacional Isla Isabel, Nayarit, para Generar Información que Apoye el Manejo con Enfoque de Ecosistemas. P3E-2010 U. de G.
- INVENTARIO DE HONGOS Y AVIFAUNA DEL ÁREA NATURAL PROTEGIDA PIEDRAS BOLA DEL EJIDO DE SANTA CRUZ DE BÁRCENAS, así como realizar el “ESTUDIO DE LA ESTRUCTURA FORESTAL DEL ÁREA NATURAL PROTEGIDA PIEDRAS BOLA DEL EJIDO DE SANTA CRUZ DE BÁRCENAS, Jalisco. De Agosto de 2011 a Marzo de 2013.
- Funcionamiento del ecosistema marino en el Parque Nacional Isla Isabel, Nayarit: conservación de biodiversidad y apoyo al manejo ecosistémico. Proyecto con apoyo PROMEP-U. de G. 2009-2013.
- Evaluación de la biodiversidad y funcionamiento de ecosistemas de arrecifes de coral en el Sistema Arrecifal Mesoamericano: apoyo al manejo ecosistémico en México, Guatemala, Honduras y Nicaragua. Proyecto apoyado por WWF Ca- CONANP-U. de G.
- Variación Espacial de la Estructura del Ensamblaje Bacteriano Asociado al Mucus de Pocillopora verrucosa y Pocillopora damicornis del Pacífico Central Méxicano y su relación con variables ambientales. Universidad de Guadalajara, P3E2014, PIFI2012-2013, PRO-SIN 2013. Monto $60,500.00
- 2196 Biodiversidad de bacterias marinas y su potencial uso como indicadores de salud de los arrecifes de coral del Pacífico Central Mexicano. Cátedras Patrimoniales CONACYT. 2014-2013. Monto $500,000.00 de equipo e infraestructura.
- Apoyo al fortalecimiento de la infraestructura del grupo de investigación en ecosistemas costeros del occidente de México: ecología, conservación biológica, sistemática y microbiología marina. Apoyo al Fortalecimiento y Desarrollo de la Infraestructura Científica y Tecnológica, Convocatoria 2015. CONACyT. Proyecto 255011. Monto $2’426,754.00 m.n. y $364,013.04 m.n. de fondo concurrente U. de G.
- Fortalecimiento del nuevo Laboratorio de Ecología Molecular, Microbiología y Taxonomía (LEMITAX) del CUCBA: implementación de un Sistema de Gestión de la Calidad ISO/IEC 17025 y acreditación ante la Entidad Mexicana de Acreditación (EMA). Coordinación de Investigación y Posgrado, Universidad de Guadalajara. Monto $626,943.82 m.n.
- Concurrencia económica para apoyar al laboratorio de ecología molecular, microbiología y taxonomía (LEMITAX) del CUCBA, para implementar un sistema de gestión de calidad y favorecer su acreditación ante la EMA: mantenimiento menor de las instalaciones e infraestructura, compra de equipo de seguridad, mantenimiento de equipo e impresión de bitácoras. Coordinación de Investigación, Posgrado y Vinculación, Universidad de Guadalajara. Monto $111,729.00 m.n.
- Equipamiento y servicio de mantenimiento para el Laboratorio de Ecología Molecular, Microbiología y Taxonomía (LEMITAX) del CUCBA: investigación, docencia y acreditación 2019. Coordinación de Investigación y Posgrado, Universidad de Guadalajara. Monto $89,912.50 m.n.
- Equipamiento y servicio de mantenimiento para el Laboratorio de Ecología Molecular, Microbiología y Taxonomía (LEMITAX) del CUCBA: investigación, docencia y acreditación 2020. Coordinación de Investigación y Posgrado, Universidad de Guadalajara. Monto $108,433.90 m.n.
- Biodiversidad bacteriana como indicador de salud en ecosistemas coralinos del Pacífico central mexicano y su relación con la condición del hábitat bentónico y fauna asociada. Ciencia Básica 2015, CONACyT. Proyecto 257987. Monto $1’426,754.00 m.n. y $215,462.10 m.n. de fondo concurrente U. de G. Proyecto terminado en CONACYT el 26 de abril del 2021.
- Equipamiento y servicio de mantenimiento para el Laboratorio de Ecología Molecular, Microbiología y Taxonomía (LEMITAX) del CUCBA: investigación, docencia y acreditación 2021. Coordinación de Investigación y Posgrado, Universidad de Guadalajara. Monto $187,118.05 m.n.
- Monitoreo biológico de ecosistemas de coral del Pacífico central mexicano ante los efectos del Evento El Niño-Oscilación del Sur (ENOS) 2023-2024.