Se presenta la vinculación directa con el sector agropecuario y ambiental con la finalidad de impactar de manera significativa en las regiones. El programa de posgrado vincula al sector productivo con la generación de conocimiento y transferencia de tecnologías para la solución de problemas relacionados con el sector agropecuario. Se organizan foros y exposiciones de proyectos y servicios con las asociaciones del Estado de Jalisco, con apoyo de la delegación regional de la SAGARPA, CONAGUA, SEMARNAT, CONAFOR y SEDER, entre otros.
Además se cuenta con la vinculación directa con centros e institutos de investigaciones, entre ellos el Colegio de Postgraduados (Campus Montecillo, Puebla, Tabasco y Veracruz), INIFAP (Diversos campos experimentales), Universidad Autónoma de Guadalajara, Universidad Autónoma de Sinaloa, Universidad Autónoma de Baja California, Universidad Autónoma de Chapingo, Benemérita Universidad Autónoma de Puebla (BUAP), Universidad Autónoma de Chiapas, Universidad Nacional Autónoma de México (UNAM), Universidad Autónoma de Saltillo, Colegio de la Frontera Sur (Unidad Villahermosa y Chiapas), e internacionales (CATIE en Costa Rica y la Universidad de Tarapacá en Chile), que fortalecerán las líneas de investigación.
La Universidad de Guadalajara desarrolla y fortalece alianzas estratégicas con el sector público federal, estatal y municipal que permiten el intercambio de conocimiento y de recursos humanos que favorecen las demandas del sector productivo y social.
Las actividades de vinculación de la Maestría se desarrollan a través de proyectos de investigación en colaboración académica, capacitación, servicios especializados, intercambio y movilidad estudiantil con diversas instituciones educativas nacionales e internacionales, de tal manera que esta vinculación contribuye también al logro de los objetivos de los actores con quienes se ha vinculado.