- Ictiología y limnología
- Sustentabilidad y conservación
- Biología y ecología de especies invasoras, especialmente en ecosistemas acuáticos.
- Biología, ecología y conservación de peces dulceacuículas.
- Estudios de relaciones tróficas en sistemas acuáticos.
- Uso de comunidades biológicas en la evaluación de la salud del ecosistema (Biomonitoreo); estimación de integridad biológica.
- Conservación de ecosistemas acuáticos en general, con especial énfasis en lagos y ríos mexicanos.